Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS45Q9NRW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms