Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms