Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms