Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms