Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms