Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms