Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POPDC2Q9HBU9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POPDC2Q9HBU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms