Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP29Q9HBJ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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