Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC52A2Q9HAB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC52A2Q9HAB3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms