Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XKR8Q9H6D3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XKR8Q9H6D3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms