Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms