Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX4Q9H1E5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX4Q9H1E5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms