Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCOLN1Q9GZU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN1Q9GZU1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms