Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms