Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSER1Q9C0I3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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