Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms