Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms