Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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FOXQ1Q9C009 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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FOXQ1Q9C009 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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FOXQ1Q9C009 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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