Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF1Q9BZW5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms