Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
REPIN1Q9BWE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms