Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms