Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TINF2Q9BSI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TINF2Q9BSI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms