Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms