Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms