Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF559Q9BR84 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF559Q9BR84 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms