Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CMSS1Q9BQ75 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMSS1Q9BQ75 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms