Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RETNLBQ9BQ08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms