Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRAMP1Q96RY5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms