Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CICQ96RK0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms