Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HHIPQ96QV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1101.9 ms