Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms