Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms