Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms