Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF4Q96M43 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF4Q96M43 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms