Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX27Q96L92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms