Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A4AQ96JQ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms