Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms