Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms