Protein–RNA interactions for Protein: Q96IR7

HPDL, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPDLQ96IR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPDLQ96IR7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms