Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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