Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms