Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms