Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL2Q969S2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL2Q969S2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms