Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms