Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms