Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP13Q92995 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP13Q92995 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP13Q92995 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP13Q92995 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms