Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC3Q92529 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC3Q92529 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC3Q92529 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC3Q92529 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC3Q92529 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms