Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms