Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms