Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCAF4Q8WV16 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms